Однако постепенно назрел конфликт между администрацией Русско-американской компании (она была частной торговой корпорацией) и монахами-миссионерами. Суть конфликта состояла в том, что монахи заступались за местных жителей, которых спаивали и притесняли торговцы. В результате этого конфликта компания урезала фонды на миссионерскую деятельность и в конце концов на Аляске остался только один монах по имени Герман, который сейчас известен как преподобный Герман Аляскинский.

Мэр Якутска отстаивает права РПЦ на остров возле Аляски